L’Humathèque propose un service de prêt entre bibliothèques (PEB), destiné aux lecteurs et lectrices résiden.t.e.s. Ce service gratuit permet d’obtenir des documents conservés dans des bibliothèques françaises ou étrangères, absentes des collections de l’Humathèque et des bibliothèques franciliennes.
Déposé à l’Humathèque, le fonds d’archives scientifiques d’Antoine Guillaumont (1915-2000) - directeur d'études à l'EPHE puis professeur au Collège de France et membre de l’Institut - et son épouse Claire Guillaumont (1916-2005), met en lumière les méthodes de recherche et de traduction de ces deux historiens du christianisme oriental ancien.